微阵列分析（微阵列分析和核型分析）

大家好，感谢邀请，今天来为大家分享一下微阵列分析的问题，以及和微阵列分析和核型分析的一些困惑，大家要是还不太明白的话，也没有关系，因为接下来将为大家分享，希望可以帮助到大家，解决大家的问题，下面就开始吧！

本文主要内容一览

• 1、cma染色体芯片不需要对照吗
• 2、微阵列分析高密芯片检查是什么
• 3、染色体微阵列分析为红色区域为缺失片段蓝色区域为重复片段是什么意思
• 4、染色体微阵列分析抽什么颜色的管
• 5、微阵列分析技术容易产前诊断需要审批吗

微阵列分析（微阵列分析和核型分析）

1cma染色体芯片不需要对照吗

需要对照。CMA，全称chromosomal microarray analysis，中文名称染色体芯片分析或基因芯片，是一项能够在全基因组范围内检测染色体拷贝数变异的技术。简单地来说，CMA是一项可以检测染色体异常的技术。

目前，CMA已广泛应用于临床自然流产的病因检测，特别是针对不明原因反复流产、胚胎停育、胚胎畸形或死胎等人群查找流产的遗传学病因具有重要意义。

微阵列分析（微阵列分析和核型分析）

2微阵列分析高密芯片检查是什么

微阵列芯片是指采用光导原位合成或微量点样等方法，将大量生物大分子比如核酸片段、多肽分子甚至组织切片、细胞等生物样品有序地固化于支持物（如玻片、尼龙膜等载体）的表面，组成密集二维分子排列，然后与已标记的待测生物样品中靶分子反应，通过特定的仪器，比如激光共聚焦扫描仪或电荷偶联摄影像机对反应信号的强度进行快速、并行、高效地检测分析，从而判断样品中靶分子的数量。微阵列（Microarray）芯片以高密度阵列为特征。其基础研究始于20世纪80年代末，本质上是一种生物技术，主要是在生物遗传学领域发展起来的。

3染色体微阵列分析为红色区域为缺失片段蓝色区域为重复片段是什么意思

意思是：染色体微缺失微重复是指染色体上缺失的或增加的片段不是特别长，一般小于10Mb，覆盖的基因数目可能不是很多。导致的疾病一般比整条染色体疾病比较起来影响略轻微，一般不会导致流产，可能在胎儿发育过程中造成某些脏器发育异常。例如DiGoerge综合征心脏异常多见，导致胎儿出生缺陷。也有较严重的微缺失微重复综合征导致智力和精神发育迟缓，患儿无自理能力，需要终身照顾。但并非所有的微缺失微重复综合征都导致严重的出生缺陷。对于基因芯片结果异常的患者，最好去正规医院产前诊断进行详细咨询，有可能需要夫妻双方基因芯片结果对照才能对异常结果进行进一步分析。并非所有的微缺失微重复综合征都需要终止妊娠。

4染色体微阵列分析抽什么颜色的管

染色体微阵列分析（CMA）技术又称“分子核型分析”，能在全基因组水平筛查发现大量的拷贝数变异（CNV），尤其是对于染色体微小缺失、重复（5 Kbp-3 Mbp）等异常的诊断优势突出。根据芯片平台及其所检测出的CNV类型的不同，CMA技术有2大类：单核苷酸多态性微列阵（SNP array）和微阵列比较基因组杂交（aCGH）技术。aCGH技术能很好地检出CNV，SNP array的优势，除了能检出CNV以外，还能够检测出大多数的UPD及低水平的嵌合体。

ISCN已经命名了染色体微阵列的部分类型，设计了2个ISCN系统：一个是详细描述异常核苷酸及周边正常核苷酸；另一个是只描述异常核苷酸。当检测出的结果比较复杂时，用清单或表格描述其结果，并有详细的说明及简要的概括。

染色体微阵列技术也有局限性。目前，芯片无法检测平衡易位、倒位、非整倍体易位来源的以及同源染色体的重复与缺失。非整倍体检测也可能出错，例如对照样品性别不正确，可导致性染色体重复。由于DNA片段大小、基因组成以及芯片所覆盖的染色体区域有别，也可能漏诊（如无法识别标记染色体）。目前，尚难以确定真正的着丝粒和染色体端粒区域的致病性异常。嵌合体低于检测范围时，也难以做出评估。此外，确定重复和缺失的临界值的方法，不同的实验室可能有差异。各实验室制定的检测基因类型的标准不同，结果也可能不同。一段DNA拷贝数有异常，并不表明本人表型异常。

5微阵列分析技术容易产前诊断需要审批吗

染色体微阵列分析(chromosomal microarray analysis，CMA)技术是一项高分辨率的全基因组筛查技术，可以检出大多数通过传统核型分析可以检出的染色体不平衡性改变，以及那些被称之为拷贝数变异(copy numbervariants，CNV)的微小缺失和重复。CNV可导致很多人类疾病，包括神经发育性疾病以及先天性异常，如先天性心脏病。CMA是先天性异常和神经发育性疾病产后诊断的一线检测技术，并被证明在产前诊断中也是一项有价值的诊断技术。CMA可用于未经培养的DNA样本，包括从CVS和羊膜腔穿刺术中获得样本，因此较核型分析的检验周期更快。

微阵列分析有哪些不同的技术类型？

在产前诊断中应用的微阵列平台主要有两种：单核苷酸多态性(single-nucleotidepolymorphism，SNP)阵列和比较基因组杂交(comparativegenomic hybridization，CGH)阵列。

标准的核型分析可以检出非整倍体、相对较大的染色体结构异常(5-10Mb以上的缺失和重复)、平衡性的易位和倒位。CMA比传统核型分析的分辨率高，可以检出低至50-100kb的缺失和重复。CMA也可以检出在核型分析中貌似平衡的重排的断裂点附近的CNV。

有一些大型的研究比较了CMA与传统核型分析在产前诊断中的应用。2012年美国国家儿童健康和人类发育研究所(NICHD)证明了对于异常超声表现者，CMA是最好的诊断技术。对于超声异常而染色体核型正常的胎儿，CMA在6%的病例中检出与临床相关的缺失和重复。对于超声结构正常、由于单纯高龄或非整倍筛查阳性而接受CVS或羊膜腔穿刺术的孕妇，CMA在1.7%的病例中检出与临床相关的缺失或重复。对4项大型研究(包括NICHD的研究)的系统回顾发现，在超声异常的病例中CMA的检出率达6.5%(201/3090)，在高龄孕妇中达1.0%(50/5108)，在其他行CVS或羊膜腔穿刺的人群中(如父母焦虑、血清学筛查阳性、染色体异常儿分娩史)可达1.1%(44/4164)。所有这些病例的核型分析均正常。

CMA相对于传统核型分析的另一个优势是这项技术不需要分裂细胞，这可以使得检验周期大大缩短。CMA也可用于获自死产标本的石蜡包埋组织，因此，只要能获得足够量的高质量DNA，CMA就可以获得结果。来自死产合作研究网络(Stillbirth Collaborative ResearchNetwork)的基于人群的532例死产病例的结果显示，CMA较标准核型分析更易获得结果(87.4% vs 70.5%，p0.0001)，从而提高对遗传学异常的检出率(8.3% vs 5.8%，p=0.0067)。

由于CMA所寻找的是不平衡性改变，因此对于完全性平衡性的染色体重排，该技术是无法检出的，但是绝大多数的平衡性重排的表型都正常。另外，CMA无法提供基因不平衡性改变的染色体机制。例如，如果有一条完整的13号染色体的重复，CMA并不能鉴别是13三体还是不平衡性罗氏易位所致，后者需要进行有关再发风险的咨询。因此，对于那些需要除外可能会遗传的易位等病例还是需要进行核型分析的。CMA也不能检出低水平嵌合，有些微阵列技术不能检出三倍体。CMA也不能检出所有的CNV，比如那些不出现在检测平台上的区域，以及低于检测水平的小CNV。在有些情况下，产后CMA可以检出的CNV无法在产前被检出，因为产后CMA平台的分辨率要比产前CMA平台的要高。另外，CMA也无法检出局限于单个基因的点突变，包括那些可以致病的点突变，如镰形细胞性贫血、囊性纤维化，以及很多骨骼发育不良性疾病。

CMA的缺点之一是无法准确解释以往未报到过的CNV的临床意义，或无法准确预测那些和一些不同结局均有相关性的CNV的表型。CNV被分为良性、有临床意义(病理性)、临床意义不明确的(variant ofuncertain significance，VUS)这三类。VUS的总体发生率约为1-2%。由NICHD发起的多中心试验报道，在核型正常的病例中，病理性CNV的发生率为0.9%，VUS的发生率为1.5%。

如果有必要应提供进一步的检测。评估的第一步就是要明确父母一方是否具有和胎儿中所检测到一样的VUS。尽管新生的CNV更可能是病理性的，但即使父母与胎儿拥有同样的CNV也不总能排除胎儿异常的可能性。当我们解释VUS的时候，对包含有缺失或重复区域的特异基因进行评估是有帮助的。总体而言，相对于小的缺失而言，小的重复具有临床意义的可能性较小。

ACOG和SMFM都推荐“应向所有孕妇通过筛查或诊断性试验的方式提供胎儿非整倍体的评估，不管孕妇的年龄大小以及有无其他高危因素……应讨论筛查试验和诊断性试验之间的区别。”特别是当存在胎儿结构异常和/或胎儿死亡而需要进行遗传学分析时，尤其应推荐进行CMA检测，在这些情况下，CMA已取代了核型分析。ACOG和SMFM推荐对于胎儿结构正常的而又接受介入性产前诊断的孕妇可以进行核型分析或CMA检测，无论孕妇的年龄大小。

目前，有些学者推荐将CMA列为胎儿染色体检测的一线方案，有些学者则推荐仅将CMA应用于胎儿结构异常的病例以减少发现VUS的可能性。NICHD研究中发现，在超声结构正常且核型正常的胎儿通过CMA检出的有临床意义的异常的发生率为1.7%(1/60)。综合5个产前CMA研究的数据，在因为孕妇高龄而进行介入性产前诊断的3151例病例中，CMA检出传统核型分析所无法检出的异常率为0.5%。

如果核型分析发现了新生的貌似平衡性的染色体重排，则应考虑行进一步的CMA检测以除外在重排断裂点处的不平衡改变。一项纳入了239例产前核型分析提示平衡性重排的研究中，CMA发现在7.9%的病例中存在断裂点处的缺失或重复。对于明确标记染色体或环状染色体的染色体来源和基因内容方面，CMA也能提供有益的信息。

什么情况下只行核型分析即可？

如果产前超声检查强烈提示胎儿罹患常见染色体非整倍体，如21、13、18三体或X单体时，则采用传统核型分析和/或快速FISH分析即可，这可以提供更快的检测周期，对于低水平嵌合以及除外易位性三体更加敏感有效。如果传统核型分析或FISH结果正常则应考虑CMA检测。对于那些有复发性流产史的夫妇采用传统核型分析以检出潜在性的平衡易位是最合适的一线方案。

有些情况下在获得异常CMA结果之后应行核型分析。如果CMA提示近端着丝粒染色体(13,14,15,21,22)三体时，应行核型分析以除外不平衡性罗氏易位。根据片段大小，推荐采用FISH或核型分析以除外涉及更小CNV的遗传性重排，这将为再次妊娠提供再发风险的准确信息。

如何对病人进行

我们推荐应由经过训练的遗传咨询师、遗传学家、或其他专家在提供检测者应熟悉其实验室所采用的微阵列平台，包括VUS率。应告知病人，与传统核型分析相比，对于超声结构异常的病例CMA可以检出额外的6-7%的病理性CNV，对于超声结果正常的病例，CMA可以检出额外的1-1.7%的病理性CNV。VUS的发生率为1.4-2.1%。检测前咨询应包括对CMA能够检测到的疾病谱的讨论，包括严重的神经系统异常以及一些较轻的成人期发病的疾病。应告知病人CMA不能检出所有的遗传性疾病或综合征，包括与单个基因点突变相关的常染色体隐性疾病。CMA也可能会发现近亲关系以及非父源性关系。

应采用什么样的标本？

可以采用提取自羊膜腔穿刺术、CVS、脐血、死产标本的DNA来进行CMA检测，更倾向于采用提取自绒毛间充质细胞和未培养羊水细胞的DNA来进行CMA检测，这可以缩短检验周期并避免培养假象的可能性。有些实验室要求同时提供母血标本，有些实验室要求同时提供双亲标本，以鉴别所检测到的CNV是遗传性的还是新发生的。

产前和产后

在产后诊断的情况下，CMA是用来解释已经存在的异常的原因，而在产前诊断的情况下，CMA是为了预测胎儿的结局。在很多产前诊断的病例中，很多病人选择进行CMA时为了确认没有有意义的发现。CMA被推荐对罹患多发性先天性异常、发育迟缓/智力障碍、和/或自闭症谱系疾病的病人进行评估的一线方案，在核型正常的情况下，CMA能够检出有临床意义的CNV的几率为15%。在产后诊断的情况下，明确诊断在很多方面对于父母而言都很重要，其中包括对寻求诊断的过程的终止，获取有关资源，未来对孩子怎样护理，以及对于再次妊娠的指导。发现一个有临床意义的CNV可以抵消发现VUS的负面影响。在产前诊断的情况下，尤其是对于超声结构正常的病例，VUS可能会带来相当的压力和焦虑，父母可能会因此选择终止妊娠。要想解释一个产前发现的CNV的意义会很困难，源于胎儿影像学发现的局限性，以及目前对于产前CNV发现和产后可能的表型之间的关系方面的信息非常有限。

为了减少发现VUS的可能性，很多专家提倡在产前诊断中采用靶向CMA而不是全基因组CMA。靶向CMA采用主要用于检出临床意义非常明确的CNV的平台，包括三体，或已被详细阐述的微缺失/微重复综合征。但是，靶向微阵列也会导致诊断产出降低的问题。在过去几年中靶向微阵列的探针密度已经增加，对CNV分类的知识也在增长，全基因组微阵列和靶向微阵列之间的差别也在日趋缩小。如前所述，产后CMA的分辨率要比产前CMA的更高，因此在有些情况下会检出产前CMA未能检出的CNV来。

其他协会有哪些有关

最近来自国际上和国内的其他协会的指南都提倡将CMA应用于产前诊断中。ACOG和SMFM在2013年发表了关于微阵列技术在产前诊断中应用的联合推荐意见，推荐将CMA应用于胎儿结构异常和/或死产的遗传学分析，并推荐在这些情况下以CMA取代核型分析。对于胎儿结构正常者，采用核型分析或CMA分析均可。全面的检测前和检测后咨询，以及知情同意都是必须的。尽管ACMG发表了针对临床实验室的指南，但组织者却没有发表针对临床医生的有关微阵列在产前诊断中应用的指南。

加拿大妇产科医师协会和加拿大医学遗传学家协会申明，不推荐对于染色体结构异常低风险的妊娠进行CMA检测，但可将CMA作为超声或MRI发现胎儿结构异常病例的产前诊断性试验。

英国医学遗传学联合委员会的一个工作小组在2015年6月推荐对于下列一项或多项胎儿结构异常者进行CMA检测，包括孤立性的≥3.5mm的NT，核型分析提示性染色体非整倍体却不能以此来解释的超声异常。意大利人类遗传学协会2012年的申明提出，CMA仅可用于胎儿结构异常的遗传学分析的二线方案，作为对产前标准核型分析的补充，而不是取而代之，以及对于新发生的染色体重排和标记染色体的分析，以明确其染色体来源和基因成分。

CMA检测前咨询的示范样本

应在行产前CMA检测前告知病人：“CMA是一项比常规核型分析或染色体分析更精细的遗传学检测，通过这项检测可以发现常规核型分析无法发现的异常。但是，有时候会发现一些临床意义不明确的小的异常，这可能会，也可能不会提示胎儿有问题。”

另外，检测前咨询还应包括：

CMA可以发现大多数核型分析能够检出的有意义的异常以及很多其他的遗传性疾病，但不能检出所有的遗传性疾病。

所检出的疾病的临床表现可能差异很大，从轻度到严重不等。对于一个既定的病人，不可能预测其结局。

CMA可能会揭示近亲或非父源关系。

所发现的遗传学改变可能会，也可能不会导致疾病的发生。有时需要获取父母双方的样本来帮助对结果的临床意义进行解释。

结果可能会揭示成人期发病的疾病，该疾病并不影响新生儿期或儿童期时的健康，但在以后的生命中其严重性尚未知。出现这样的结果也提示双亲之一也罹患同样的成人期发病的疾病但尚未出现症状。