染色质免疫沉淀（染色质免疫沉淀的原理）

染色质免疫沉淀

徐进课题组研究发现，染色质免疫沉淀，镁毒害诱导拟南芥根细胞死亡，因而抑制了植物主根生长。他们随后对镁毒害下植物中差异表达的基因进行调控网络分析，鉴定到一个磷酸乙醇胺N—甲基转移酶基因XIPOTL1参与镁毒害介导的根尖细胞死亡。进一步研究发现一个NAC32转录因子与XIPOTL1基因的启动子之间存在相互作用。随后，染色质免疫沉淀，徐进课题组通过染色质免疫沉淀等分子生物学技术进一步确认NAC32与XIPOTL1基因启动子区域的结合。

染色质免疫沉淀（染色质免疫沉淀的原理）

遗传学分析表明，XIPOTL1基因在NAC32过量表达的转基因株系OX32中表达上调，而在NAC32突变体nac32中下调。该课题组同时发现，nac32突变体对镁毒害的敏感性增加，相反NAC32过量表达转基因株系OX32对镁毒害表现出耐受。

染色质免疫沉淀的原理

染色质免疫沉淀分析(ChIP)是目前确定与特定蛋白结合的基因组区域或确定与特定基因组区域结合的蛋白质的比较好的一种方法。so，我们今天来聊聊染色质免疫沉淀分析方法。

染色质免疫沉淀法（Chromatinimmunoprecipitation，ChIP）是研究体内DNA与蛋白质相互作用的重要工具。它可以灵敏地检测目标蛋白与特异DNA丨片段的结合情况，还可以用来研究组蛋白与基因表达的关系。

CHIP技术通过三大步骤实现：第1，甲醛固定后染色质分离和断片；第2，运用特异蛋白质抗体（CHIP级别），免疫共沉淀结合蛋白的染色质片段；第3，分析目标DNA。

这里我们就要说到CHIP技术工具之——植物染色质免疫沉淀试剂盒了。它的原理是什么呢？不妨以P-2014植物染色质免疫沉淀试剂盒来举个栗子~~

染色质免疫沉淀技术ChIP

罗雄剑课题组结合染色质免疫共沉淀测序和位置矩阵数据，染色质免疫沉淀，鉴别到34个打断与转录因子结合的抑郁症风险遗传变异。他们利用系列功能实验，系统性地研究了这些功能遗传变异调控靶基因的潜在机制。进一步的表达数量性状基因座分析揭示了受这些功能性遗传变异调控的潜在靶基因。研究提示，这些遗传变异可能同影响与转录因子结合，进而调控抑郁症易感基因的表达，最终导致抑郁症发生。

这个研究从GWAS鉴别到的抑郁症风险遗传变异中甄别出具有功能后果(或者潜在致病)的遗传变异，提示这些功能风险遗传变异可能通过影响与转录因子结合进而调控抑郁症风险基因的表达，并初步鉴别出受这些功能遗传变异调控的靶基因。进一步对这些功能遗传变异(或者致病)及靶基因的研究将有助于解析抑郁症的遗传机制和致病机理，染色质免疫沉淀，从而为抑郁症的治疗提供新的潜在靶点。(完)